Het belangrijkste verschil tussen chlorofyl A en B is dat het chlorofyl A het primaire fotosynthetische pigment is in planten en algen, terwijl het chlorofyl B een bijkomend pigment is dat energie verzamelt en doorgeeft aan chlorofyl A.
Chlorofyl is een familie van natuurlijke pigmenten die in planten en algen voorkomen en verantwoordelijk zijn voor hun groene kleur. Chlorofyl absorbeert energie uit zonlicht en gebruikt deze energie om koolhydraten te synthetiseren uit water en kooldioxide. Het is het proces dat fotosynthese wordt genoemd dat levensprocessen in alle planten ondersteunt, aangezien door dit proces aan hun energiebehoeften wordt voldaan. Bovendien is fotosynthese het belangrijkste proces dat alle levende organismen ondersteunt, aangezien planten de belangrijkste producenten zijn van alle voedselketens. Dieren en mensen consumeren producten van planten. In de chlorofylpigmentfamilie zijn er verschillende soorten chlorofylpigmenten. Onder hen zijn chlorofyl A en chlorofyl B twee soorten chlorofylen. Ze hebben een vergelijkbare structuur met een klein verschil in de porfyrinering. Chlorofyl A heeft CH3 groepen in de porfyrinering terwijl chlorofyl B een CHO (aldehydegroep) in de porfyrinering heeft.
