Het belangrijkste verschil tussen bioreactor en fermentor is het type biochemische reactie dat plaatsvindt in de gesloten vaten. Een bioreactor faciliteert alle soorten biochemische reacties, maar een fermentor faciliteert alleen fermentatie.
De toepassing van biotechnologie in de industrie is een interessant wetenschapsgebied. Deze toepassingen variëren van microbiële toepassingen tot dierlijke toepassingen. Bovendien variëren de industriële toepassingen van biotechnologie over de hoofdgebieden, zoals landbouw, geneeskunde en verschillende industrieën. Bioreactoren zijn gesloten vaten waarin de nodige voorwaarden worden gecreëerd om verschillende soorten biochemische reacties mogelijk te maken. Fermentoren behoren tot de groep van bioreactoren, maar zijn vooral bedoeld om alleen fermentatie uit te voeren.