Het belangrijkste verschil tussen microfaag en macrofaag is dat de microfaag een soort kleine fagocyt is die slechts een paar dagen leeft, terwijl de macrofaag een soort grotere fagocyt is met een langere levensduur.
Ons immuunsysteem vecht met binnendringende pathogene micro-organismen en houdt ons veilig. Daarom is het een complex systeem dat veel verschillende verdedigingsmechanismen uitvoert om indringers op te sporen en te vernietigen. Fagocytose is een mechanisme waarbij fagocyten binnendringende deeltjes opnemen en doden. Fagocyten zijn cellen die bacteriën kunnen overspoelen en absorberen, en andere vreemde cellen en infectieuze deeltjes vernietigen zich daarin. Dienovereenkomstig zijn er twee hoofdtypen fagocyten, namelijk microfaag en macrofaag. Microfaag is een kleine polymorfonucleaire fagocyt die in grote aantallen voorkomt. Aan de andere kant is de macrofaag een soort fagocyt die op verschillende belangrijke locaties in ons lichaam is gestationeerd om te fungeren als een verdedigingsmechanisme in de frontlinie tegen binnendringende deeltjes. Zij zijn de grote eters in ons immuunsysteem.
