De belangrijk verschil tussen fucoidan en fucoxanthine is dat fucoidan een fucose-bevattend gesulfateerd polysaccharide is dat aanwezig is in verschillende soorten bruine algen en bruin zeewier, terwijl fucoxanthine een xanthofyl is dat aanwezig is als accessoire pigment in de chloroplasten van bruine algen en andere heterokonts.
Mariene ecosystemen vormen zowel flora als fauna. Ze hebben een grote diversiteit aan soorten. Bovendien bevatten deze soorten verschillende verbindingen die gunstig zijn voor mensen. De biomoleculen die uit deze soorten worden gewonnen in mariene ecosystemen, bevatten verschillende therapeutische mogelijkheden. Fucoidan en fucoxanthine zijn twee van dergelijke verbindingen die aanwezig zijn in mariene ecosystemen, voornamelijk in bruine algen. Hoewel ze chemisch verschillen, worden beide verbindingen momenteel gebruikt voor verschillende onderzoeksdoeleinden om hun potentieel als therapeutica te identificeren.