Het belangrijkste verschil tussen snRNA en snRNP is dat snRNA's kleine nucleaire RNA-moleculen zijn, terwijl snRNP's of kleine nucleaire ribonucleoproteïnen kleine nucleaire RNA-moleculen met eiwitten zijn.
snRNA's zijn niet-coderende, biologisch actieve kleine RNA-moleculen met een gemiddelde grootte van 150 nucleotiden. Ze zijn meestal aanwezig in combinatie met eiwitten als snRNP's in de natuurlijke staat. Daarom zijn snRNP's klein nucleair RNA met verschillende snRNP-specifieke eiwitten. snRNP's zijn betrokken bij het mediëren of reguleren van posttranslationele RNA-verwerkingsgebeurtenissen zoals splicing, enz. Zowel snRNA als snRNP worden aangetroffen in de kern van eukaryote cellen.
