Het belangrijkste verschil tussen auxine en cytokinine is dat het auxine de wortelvertakking stimuleert, terwijl het cytokinine wortelvertakking en de laterale wortelvorming remt. Om hier nog meer aan toe te voegen, is auxine voornamelijk verantwoordelijk voor het verlengen van cellen in de stam- en wortelpunten, terwijl cytokinines voornamelijk verantwoordelijk zijn voor celdeling en daarom worden ze in groeigebieden aangetroffen.
Fytohormonen, ook wel plantenhormonen genoemd, zijn belangrijke chemische stoffen voor plantengroei en -ontwikkeling. Het zijn organische moleculen en ze werken als signaalmoleculen die de ontwikkeling van planten reguleren. Er zijn vijf belangrijke soorten plantenhormonen: auxine, gibberelline, cytokinine, ethyleen en abscisinezuur. Ze vervullen dus verschillende functies alleen en samen om de plantengroei te beïnvloeden.