Het belangrijkste verschil tussen microspore en stuifmeelkorrel is dat microspore de kleine sporen zijn die zich ontwikkelen tot de mannelijke gametofyt in planten, terwijl stuifmeelkorrel de kleine korrel is die de mannelijke gametofyt bevat.
De voortplanting van planten vindt zowel seksueel als ongeslachtelijk plaats, en toont de afwisseling van generatie. Er zijn twee generaties bekend als sporofytische generatie en gametofytische generatie. Microspore en pollenkorrel zijn twee structuren die zich tijdens deze twee generaties ontwikkelen. Microspore is een structuur van sporofytische generatie, terwijl stuifmeelkorrel een structuur is van gametofytische generatie. Ook is de microscoop geen gametofyt, terwijl stuifmeelkorrel een gametofyt is.
