siRNA versus miRNA
RNA's zijn zeer belangrijke moleculen die helpen bij het opbouwen van het leven van organismen. Onlangs hebben wetenschappers kleine RNA's ontdekt, RNA-interferentie of RNAi genaamd, die na de transcriptie de genexpressie regelen. De twee belangrijkste soorten kleine RNA's zijn micro-RNA of miRNA en klein interfererend RNA of siRNA. Deze moleculen reguleren in feite de genexpressie door het doelgen te onderdrukken. Zowel miRNA als siRNA hebben zeer vergelijkbare biogenese-routes, hoewel er enkele verschillen tussen beide bestaan. De oorsprong van miRNA en siRNA is van dsRNA-moleculen. Rijpe miRNA's zijn structureel vergelijkbaar met siRNA-moleculen.
miRNA
Micro-RNA's of miRNA's zijn de kleine RNA-moleculen die de laatste controle in translationele genregulatie bemiddelen. Deregulering van miRNA kan leiden tot de ontwikkeling van kanker en andere ziekten. Daarom is de juiste regulering van informatie die is gecodeerd in het niet-coderende gebied van miRNA, erg cruciaal in veel fundamentele cellulaire processen.
siRNA
siRNA's worden ook wel kort interfererend of silencing-RNA genoemd en bestaan uit dubbelstrengs RNA met 20 tot 25 basenparen. De belangrijkste rol van siRNA is om te interfereren met de expressie van specifieke genen met complementaire nucleotidesequenties. siRNA bestaat uit kort dubbelstrengs RNA met gefosforyleerde 5'-uiteinden en gehydroxyleerde 3'-uiteinden met twee overhangende nucleotiden.
Wat is het verschil tussen siRNA en miRNA?
• miRNA afgeleid van specifieke genomische loci, terwijl siRNA afgeleid van mRNA, transposons, virussen of heterochromatisch DNA.
• Synthese van miRNA wordt verwerkt uit langere precursor-haarspeldtranscripten (primaire nucleaire miRNA-sequentie door RNase III-endonuclease), terwijl die van siRNA wordt verwerkt uit lange bimoleculaire RNA-duplexen.
• Elk miRNA-haarspeld-precursormolecuul produceert enkele miRNA-duplex, terwijl elk siRNA-precursormolecuul meerdere siRNA-duplexen produceert.
• siRNA-sequenties worden zelden geconserveerd, terwijl miRNA-sequenties goed geconserveerd zijn.
• Alle basen binnen siRNA dragen bij aan de specificiteit van het doelwit, terwijl slechts 5 'de helft van miRNA bijdraagt aan de specificiteit van het doelwit.
• miRNA bindt vaak aan het 3'-onvertaalde gebied van doelwittranscripten, terwijl siRNA's complementaire duplex vormen overal langs een doelwit-mRNA.
• miRNA specificeert 'hetero-silencing' terwijl siRNA wordt gebruikt voor 'auto silencing'.
• miRNA fungeert als een signaal om translatie te voorkomen, terwijl siRNA translatie fysiek voorkomt.
