Het belangrijkste verschil tussen Klebsiella pneumoniae en Streptococcus pneumoniae is dat Klebsiella pneumoniae een gramnegatieve staafvormige bacterie is, terwijl Streptococcus pneumoniae grampositieve, niet-beweeglijke en niet-porulerende ovale of bolvormige bacteriën is.
Zowel Klebsiella pneumoniae als Streptococcus pneumoniae zijn twee verschillende bacteriën die longontsteking veroorzaken, en verschillende andere soorten infecties. Beide soorten bacteriën zijn facultatieve anaëroben die niet beweeglijk zijn. Omdat beide bacteriën resistentie tegen antibiotica ontwikkelen, is het moeilijk om hun infecties te behandelen.